miRDeep2.0.0.8 RNAfold was/is not installed properly 解决方法

在安装miRDeep2.0.0.8过程中,执行

perl install.pl

后会发生

RNAfold was/is not installed properly

的错误,然而实际上在 /essentials/ViennaRNA-1.8.4 内已经安装好了install.pl脚本下载的ViennaRNA。

输入 RNAfold

出现

Input string (upper or lower case); @ to quit

…,….1….,….2….,….3….,….4….,….5….,….6….,….7….,….8

证明RNAfold确实已经安装上了。

运行 /bin/mapper.pl 测试,此时会提示你未安装,让重新运行install.pl。

切换到miRDeep目录,运行

touch install_successful

然后再运行/bin/mapper.pl测试,证明安装成功!

此外还可以用

sh tutorial_dir/run_tut.sh

来测试是否安装成功。

!!!

此时再去运行install.pl还是会提示 RNAfold 未安装成功,但其实所有程序都可以使用了。

Zhao Li /
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